മകരവിളക്കിനോടനുബന്ധിച്ച് മകരസംക്രമപൂജ നടത്താറുണ്ട്. സൂര്യന് ധനു രാശിയില് നിന്നും മകരം രാശിയിലേക്ക് മാറുന്ന സംക്രമവേളയിലാണ് ഇത് നടത്തുക. സൂര്യന് രാശി മാറുന്ന മുഹൂര്ത്തത്തില് സംക്രമാഭിഷേകവും നടക്കും. തിരുവിതാംകൂര് രാജവംശത്തിന്റെ കവടിയാര് കൊട്ടാരത്തില് നിന്നു പ്രത്യേക ദൂതന് വശം കൊണ്ടുവരുന്ന അയ്യപ്പ മുദ്രയിലെ നെയ്യ് ഉപയോഗിച്ചാണ് സംക്രമവേളയില് അയ്യന് അഭിഷേകം നടത്തുക.